Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB51

Ccdc117, Coiled-coil domain-containing protein 117, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc117Q6PB51 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc117Q6PB51 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.2 ms