Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Soga3Q6NZL0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Soga3Q6NZL0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Soga3Q6NZL0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Soga3Q6NZL0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Soga3Q6NZL0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Soga3Q6NZL0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Soga3Q6NZL0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Soga3Q6NZL0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Soga3Q6NZL0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Soga3Q6NZL0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Soga3Q6NZL0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Soga3Q6NZL0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Soga3Q6NZL0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Soga3Q6NZL0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Soga3Q6NZL0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Soga3Q6NZL0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Soga3Q6NZL0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Soga3Q6NZL0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Soga3Q6NZL0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Soga3Q6NZL0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Soga3Q6NZL0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Soga3Q6NZL0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Soga3Q6NZL0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Soga3Q6NZL0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Soga3Q6NZL0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Soga3Q6NZL0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Soga3Q6NZL0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Soga3Q6NZL0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Soga3Q6NZL0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Soga3Q6NZL0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Soga3Q6NZL0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Soga3Q6NZL0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Soga3Q6NZL0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Soga3Q6NZL0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Soga3Q6NZL0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Soga3Q6NZL0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Soga3Q6NZL0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Soga3Q6NZL0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Soga3Q6NZL0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Soga3Q6NZL0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Soga3Q6NZL0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Soga3Q6NZL0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Soga3Q6NZL0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Soga3Q6NZL0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Soga3Q6NZL0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Soga3Q6NZL0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Soga3Q6NZL0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Soga3Q6NZL0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Soga3Q6NZL0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Soga3Q6NZL0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Soga3Q6NZL0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Soga3Q6NZL0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Soga3Q6NZL0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Soga3Q6NZL0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Soga3Q6NZL0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Soga3Q6NZL0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Soga3Q6NZL0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Soga3Q6NZL0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Soga3Q6NZL0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Soga3Q6NZL0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Soga3Q6NZL0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Soga3Q6NZL0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Soga3Q6NZL0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Soga3Q6NZL0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Soga3Q6NZL0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Soga3Q6NZL0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Soga3Q6NZL0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Soga3Q6NZL0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Soga3Q6NZL0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Soga3Q6NZL0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Soga3Q6NZL0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Soga3Q6NZL0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Soga3Q6NZL0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Soga3Q6NZL0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Soga3Q6NZL0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Soga3Q6NZL0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Soga3Q6NZL0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Soga3Q6NZL0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Soga3Q6NZL0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Soga3Q6NZL0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Soga3Q6NZL0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Soga3Q6NZL0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Soga3Q6NZL0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Soga3Q6NZL0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Soga3Q6NZL0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Soga3Q6NZL0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Soga3Q6NZL0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Soga3Q6NZL0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Soga3Q6NZL0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Soga3Q6NZL0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Soga3Q6NZL0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Soga3Q6NZL0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Soga3Q6NZL0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Soga3Q6NZL0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Soga3Q6NZL0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Soga3Q6NZL0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Soga3Q6NZL0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Soga3Q6NZL0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Soga3Q6NZL0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms