Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVG7

Colgalt2, Procollagen galactosyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt2Q6NVG7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Colgalt2Q6NVG7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Colgalt2Q6NVG7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Colgalt2Q6NVG7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Colgalt2Q6NVG7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Colgalt2Q6NVG7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Colgalt2Q6NVG7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Colgalt2Q6NVG7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Colgalt2Q6NVG7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Colgalt2Q6NVG7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Colgalt2Q6NVG7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Colgalt2Q6NVG7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Colgalt2Q6NVG7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Colgalt2Q6NVG7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Colgalt2Q6NVG7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Colgalt2Q6NVG7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Colgalt2Q6NVG7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Colgalt2Q6NVG7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Colgalt2Q6NVG7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Colgalt2Q6NVG7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Colgalt2Q6NVG7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Colgalt2Q6NVG7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Colgalt2Q6NVG7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Colgalt2Q6NVG7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Colgalt2Q6NVG7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Colgalt2Q6NVG7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Colgalt2Q6NVG7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Colgalt2Q6NVG7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Colgalt2Q6NVG7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Colgalt2Q6NVG7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Colgalt2Q6NVG7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Colgalt2Q6NVG7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Colgalt2Q6NVG7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Colgalt2Q6NVG7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Colgalt2Q6NVG7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Colgalt2Q6NVG7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Colgalt2Q6NVG7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Colgalt2Q6NVG7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Colgalt2Q6NVG7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Colgalt2Q6NVG7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Colgalt2Q6NVG7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Colgalt2Q6NVG7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Colgalt2Q6NVG7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Colgalt2Q6NVG7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Colgalt2Q6NVG7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Colgalt2Q6NVG7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Colgalt2Q6NVG7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Colgalt2Q6NVG7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Colgalt2Q6NVG7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Colgalt2Q6NVG7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Colgalt2Q6NVG7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Colgalt2Q6NVG7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Colgalt2Q6NVG7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Colgalt2Q6NVG7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Colgalt2Q6NVG7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Colgalt2Q6NVG7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Colgalt2Q6NVG7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Colgalt2Q6NVG7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Colgalt2Q6NVG7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Colgalt2Q6NVG7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Colgalt2Q6NVG7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Colgalt2Q6NVG7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Colgalt2Q6NVG7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Colgalt2Q6NVG7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Colgalt2Q6NVG7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Colgalt2Q6NVG7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Colgalt2Q6NVG7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Colgalt2Q6NVG7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Colgalt2Q6NVG7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Colgalt2Q6NVG7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Colgalt2Q6NVG7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Colgalt2Q6NVG7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Colgalt2Q6NVG7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Colgalt2Q6NVG7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Colgalt2Q6NVG7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Colgalt2Q6NVG7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Colgalt2Q6NVG7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Colgalt2Q6NVG7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Colgalt2Q6NVG7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Colgalt2Q6NVG7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Colgalt2Q6NVG7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Colgalt2Q6NVG7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Colgalt2Q6NVG7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Colgalt2Q6NVG7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Colgalt2Q6NVG7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Colgalt2Q6NVG7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Colgalt2Q6NVG7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Colgalt2Q6NVG7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Colgalt2Q6NVG7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Colgalt2Q6NVG7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Colgalt2Q6NVG7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Colgalt2Q6NVG7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Colgalt2Q6NVG7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Colgalt2Q6NVG7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Colgalt2Q6NVG7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Colgalt2Q6NVG7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Colgalt2Q6NVG7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Colgalt2Q6NVG7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Colgalt2Q6NVG7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Colgalt2Q6NVG7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms