Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scaf8Q6DID3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scaf8Q6DID3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scaf8Q6DID3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scaf8Q6DID3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scaf8Q6DID3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scaf8Q6DID3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Scaf8Q6DID3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scaf8Q6DID3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scaf8Q6DID3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scaf8Q6DID3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scaf8Q6DID3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scaf8Q6DID3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Scaf8Q6DID3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scaf8Q6DID3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scaf8Q6DID3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scaf8Q6DID3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scaf8Q6DID3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scaf8Q6DID3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scaf8Q6DID3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scaf8Q6DID3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scaf8Q6DID3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scaf8Q6DID3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scaf8Q6DID3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scaf8Q6DID3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scaf8Q6DID3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scaf8Q6DID3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scaf8Q6DID3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scaf8Q6DID3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scaf8Q6DID3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scaf8Q6DID3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scaf8Q6DID3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scaf8Q6DID3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scaf8Q6DID3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scaf8Q6DID3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scaf8Q6DID3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scaf8Q6DID3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scaf8Q6DID3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scaf8Q6DID3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scaf8Q6DID3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scaf8Q6DID3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Scaf8Q6DID3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scaf8Q6DID3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scaf8Q6DID3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scaf8Q6DID3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scaf8Q6DID3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Scaf8Q6DID3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scaf8Q6DID3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scaf8Q6DID3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scaf8Q6DID3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scaf8Q6DID3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scaf8Q6DID3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scaf8Q6DID3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scaf8Q6DID3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scaf8Q6DID3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Scaf8Q6DID3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Scaf8Q6DID3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Scaf8Q6DID3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Scaf8Q6DID3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Scaf8Q6DID3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Scaf8Q6DID3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Scaf8Q6DID3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Scaf8Q6DID3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Scaf8Q6DID3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Scaf8Q6DID3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scaf8Q6DID3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scaf8Q6DID3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scaf8Q6DID3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scaf8Q6DID3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scaf8Q6DID3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scaf8Q6DID3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scaf8Q6DID3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scaf8Q6DID3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scaf8Q6DID3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scaf8Q6DID3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scaf8Q6DID3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scaf8Q6DID3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scaf8Q6DID3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scaf8Q6DID3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scaf8Q6DID3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scaf8Q6DID3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Scaf8Q6DID3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Scaf8Q6DID3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Scaf8Q6DID3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scaf8Q6DID3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scaf8Q6DID3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scaf8Q6DID3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scaf8Q6DID3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scaf8Q6DID3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scaf8Q6DID3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scaf8Q6DID3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scaf8Q6DID3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scaf8Q6DID3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scaf8Q6DID3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Scaf8Q6DID3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scaf8Q6DID3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scaf8Q6DID3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scaf8Q6DID3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scaf8Q6DID3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scaf8Q6DID3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.3 ms