Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmcc1Q69ZZ6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tmcc1Q69ZZ6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tmcc1Q69ZZ6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tmcc1Q69ZZ6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmcc1Q69ZZ6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmcc1Q69ZZ6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmcc1Q69ZZ6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmcc1Q69ZZ6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmcc1Q69ZZ6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmcc1Q69ZZ6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmcc1Q69ZZ6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmcc1Q69ZZ6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmcc1Q69ZZ6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmcc1Q69ZZ6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmcc1Q69ZZ6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmcc1Q69ZZ6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmcc1Q69ZZ6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmcc1Q69ZZ6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmcc1Q69ZZ6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmcc1Q69ZZ6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmcc1Q69ZZ6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmcc1Q69ZZ6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmcc1Q69ZZ6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmcc1Q69ZZ6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmcc1Q69ZZ6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmcc1Q69ZZ6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmcc1Q69ZZ6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmcc1Q69ZZ6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmcc1Q69ZZ6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmcc1Q69ZZ6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmcc1Q69ZZ6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmcc1Q69ZZ6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmcc1Q69ZZ6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmcc1Q69ZZ6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmcc1Q69ZZ6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmcc1Q69ZZ6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmcc1Q69ZZ6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmcc1Q69ZZ6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmcc1Q69ZZ6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmcc1Q69ZZ6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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