Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf6Q62311 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf6Q62311 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms