Protein–RNA interactions for Protein: Q62232

Six2, Homeobox protein SIX2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six2Q62232 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Six2Q62232 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Six2Q62232 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Six2Q62232 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Six2Q62232 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Six2Q62232 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Six2Q62232 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Six2Q62232 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Six2Q62232 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Six2Q62232 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Six2Q62232 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Six2Q62232 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Six2Q62232 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Six2Q62232 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Six2Q62232 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Six2Q62232 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Six2Q62232 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Six2Q62232 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Six2Q62232 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Six2Q62232 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Six2Q62232 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Six2Q62232 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Six2Q62232 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Six2Q62232 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Six2Q62232 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Six2Q62232 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Six2Q62232 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Six2Q62232 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Six2Q62232 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Six2Q62232 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Six2Q62232 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Six2Q62232 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Six2Q62232 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Six2Q62232 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Six2Q62232 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Six2Q62232 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Six2Q62232 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Six2Q62232 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms