Protein–RNA interactions for Protein: Q62179

Sema4b, Semaphorin-4B, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4bQ62179 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema4bQ62179 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sema4bQ62179 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema4bQ62179 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema4bQ62179 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema4bQ62179 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema4bQ62179 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema4bQ62179 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema4bQ62179 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema4bQ62179 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema4bQ62179 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema4bQ62179 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema4bQ62179 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema4bQ62179 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema4bQ62179 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema4bQ62179 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema4bQ62179 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema4bQ62179 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema4bQ62179 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema4bQ62179 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema4bQ62179 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema4bQ62179 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema4bQ62179 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema4bQ62179 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema4bQ62179 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema4bQ62179 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema4bQ62179 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema4bQ62179 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema4bQ62179 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema4bQ62179 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema4bQ62179 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema4bQ62179 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema4bQ62179 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema4bQ62179 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema4bQ62179 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema4bQ62179 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema4bQ62179 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema4bQ62179 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema4bQ62179 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema4bQ62179 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema4bQ62179 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema4bQ62179 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema4bQ62179 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema4bQ62179 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema4bQ62179 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema4bQ62179 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema4bQ62179 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema4bQ62179 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema4bQ62179 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema4bQ62179 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema4bQ62179 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema4bQ62179 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms