Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Odf1Q61999 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms