Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Foxd4Q60688 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Foxd4Q60688 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Foxd4Q60688 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Foxd4Q60688 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Foxd4Q60688 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Foxd4Q60688 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Foxd4Q60688 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Foxd4Q60688 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Foxd4Q60688 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Foxd4Q60688 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Foxd4Q60688 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Foxd4Q60688 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Foxd4Q60688 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Foxd4Q60688 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Foxd4Q60688 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Foxd4Q60688 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Foxd4Q60688 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Foxd4Q60688 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Foxd4Q60688 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Foxd4Q60688 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Foxd4Q60688 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Foxd4Q60688 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Foxd4Q60688 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Foxd4Q60688 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Foxd4Q60688 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Foxd4Q60688 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Foxd4Q60688 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Foxd4Q60688 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Foxd4Q60688 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Foxd4Q60688 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Foxd4Q60688 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Foxd4Q60688 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Foxd4Q60688 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Foxd4Q60688 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Foxd4Q60688 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Foxd4Q60688 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 721.8 ms