Protein–RNA interactions for Protein: Q5TIS6

Noto, Homeobox protein notochord, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NotoQ5TIS6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NotoQ5TIS6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NotoQ5TIS6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms