Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Med13Q5SWW4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Med13Q5SWW4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Med13Q5SWW4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Med13Q5SWW4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Med13Q5SWW4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Med13Q5SWW4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Med13Q5SWW4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Med13Q5SWW4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Med13Q5SWW4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Med13Q5SWW4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Med13Q5SWW4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Med13Q5SWW4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Med13Q5SWW4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Med13Q5SWW4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Med13Q5SWW4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Med13Q5SWW4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Med13Q5SWW4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Med13Q5SWW4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Med13Q5SWW4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Med13Q5SWW4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Med13Q5SWW4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Med13Q5SWW4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Med13Q5SWW4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Med13Q5SWW4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Med13Q5SWW4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Med13Q5SWW4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Med13Q5SWW4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Med13Q5SWW4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Med13Q5SWW4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Med13Q5SWW4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Med13Q5SWW4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Med13Q5SWW4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Med13Q5SWW4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Med13Q5SWW4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Med13Q5SWW4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Med13Q5SWW4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Med13Q5SWW4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Med13Q5SWW4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Med13Q5SWW4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Med13Q5SWW4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Med13Q5SWW4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Med13Q5SWW4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Med13Q5SWW4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Med13Q5SWW4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms