Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUQ9

Ctc1, CST complex subunit CTC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctc1Q5SUQ9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctc1Q5SUQ9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctc1Q5SUQ9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctc1Q5SUQ9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctc1Q5SUQ9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctc1Q5SUQ9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctc1Q5SUQ9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctc1Q5SUQ9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctc1Q5SUQ9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctc1Q5SUQ9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctc1Q5SUQ9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctc1Q5SUQ9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctc1Q5SUQ9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctc1Q5SUQ9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctc1Q5SUQ9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctc1Q5SUQ9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctc1Q5SUQ9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctc1Q5SUQ9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctc1Q5SUQ9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ctc1Q5SUQ9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Ctc1Q5SUQ9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctc1Q5SUQ9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ctc1Q5SUQ9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ctc1Q5SUQ9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ctc1Q5SUQ9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ctc1Q5SUQ9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ctc1Q5SUQ9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ctc1Q5SUQ9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ctc1Q5SUQ9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctc1Q5SUQ9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctc1Q5SUQ9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctc1Q5SUQ9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctc1Q5SUQ9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctc1Q5SUQ9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctc1Q5SUQ9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctc1Q5SUQ9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctc1Q5SUQ9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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