Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3R4

Itga1, Integrin alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga1Q3V3R4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga1Q3V3R4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga1Q3V3R4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga1Q3V3R4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga1Q3V3R4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga1Q3V3R4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga1Q3V3R4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga1Q3V3R4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga1Q3V3R4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga1Q3V3R4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga1Q3V3R4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga1Q3V3R4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga1Q3V3R4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga1Q3V3R4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga1Q3V3R4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga1Q3V3R4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga1Q3V3R4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga1Q3V3R4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga1Q3V3R4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itga1Q3V3R4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itga1Q3V3R4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itga1Q3V3R4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itga1Q3V3R4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itga1Q3V3R4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itga1Q3V3R4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itga1Q3V3R4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itga1Q3V3R4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itga1Q3V3R4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itga1Q3V3R4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itga1Q3V3R4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itga1Q3V3R4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itga1Q3V3R4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itga1Q3V3R4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itga1Q3V3R4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Itga1Q3V3R4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Itga1Q3V3R4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itga1Q3V3R4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itga1Q3V3R4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itga1Q3V3R4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Itga1Q3V3R4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itga1Q3V3R4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itga1Q3V3R4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Itga1Q3V3R4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Itga1Q3V3R4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Itga1Q3V3R4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Itga1Q3V3R4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Itga1Q3V3R4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Itga1Q3V3R4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itga1Q3V3R4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itga1Q3V3R4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itga1Q3V3R4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itga1Q3V3R4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itga1Q3V3R4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itga1Q3V3R4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itga1Q3V3R4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itga1Q3V3R4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itga1Q3V3R4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itga1Q3V3R4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itga1Q3V3R4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga1Q3V3R4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga1Q3V3R4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga1Q3V3R4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga1Q3V3R4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga1Q3V3R4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga1Q3V3R4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga1Q3V3R4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga1Q3V3R4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga1Q3V3R4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga1Q3V3R4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga1Q3V3R4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga1Q3V3R4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga1Q3V3R4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga1Q3V3R4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga1Q3V3R4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga1Q3V3R4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga1Q3V3R4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga1Q3V3R4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga1Q3V3R4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga1Q3V3R4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga1Q3V3R4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga1Q3V3R4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga1Q3V3R4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga1Q3V3R4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga1Q3V3R4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga1Q3V3R4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga1Q3V3R4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga1Q3V3R4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga1Q3V3R4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga1Q3V3R4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga1Q3V3R4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga1Q3V3R4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga1Q3V3R4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga1Q3V3R4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga1Q3V3R4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga1Q3V3R4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms