Protein–RNA interactions for Protein: Q3UST5

UPF0764 protein C16orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UST5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Q3UST5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Q3UST5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Q3UST5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q3UST5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q3UST5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q3UST5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q3UST5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q3UST5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q3UST5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q3UST5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q3UST5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q3UST5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q3UST5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q3UST5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q3UST5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q3UST5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q3UST5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q3UST5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q3UST5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q3UST5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q3UST5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q3UST5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q3UST5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q3UST5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q3UST5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Q3UST5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Q3UST5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Q3UST5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Q3UST5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Q3UST5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Q3UST5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Q3UST5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Q3UST5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Q3UST5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Q3UST5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Q3UST5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Q3UST5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Q3UST5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Q3UST5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Q3UST5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q3UST5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q3UST5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q3UST5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q3UST5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q3UST5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q3UST5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q3UST5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q3UST5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Q3UST5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Q3UST5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Q3UST5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Q3UST5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Q3UST5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Q3UST5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Q3UST5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Q3UST5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Q3UST5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Q3UST5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Q3UST5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Q3UST5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Q3UST5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Q3UST5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Q3UST5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Q3UST5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Q3UST5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Q3UST5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Q3UST5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Q3UST5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Q3UST5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Q3UST5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Q3UST5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Q3UST5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Q3UST5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Q3UST5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Q3UST5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Q3UST5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Q3UST5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Q3UST5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Q3UST5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Q3UST5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Q3UST5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Q3UST5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Q3UST5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Q3UST5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Q3UST5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Q3UST5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Q3UST5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Q3UST5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Q3UST5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Q3UST5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q3UST5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q3UST5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q3UST5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q3UST5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q3UST5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q3UST5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q3UST5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q3UST5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Q3UST5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms