Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPW2

Elf3, ETS-related transcription factor Elf-3, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elf3Q3UPW2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Elf3Q3UPW2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Elf3Q3UPW2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Elf3Q3UPW2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Elf3Q3UPW2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Elf3Q3UPW2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Elf3Q3UPW2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Elf3Q3UPW2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Elf3Q3UPW2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Elf3Q3UPW2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Elf3Q3UPW2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Elf3Q3UPW2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Elf3Q3UPW2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Elf3Q3UPW2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Elf3Q3UPW2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Elf3Q3UPW2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Elf3Q3UPW2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Elf3Q3UPW2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Elf3Q3UPW2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Elf3Q3UPW2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Elf3Q3UPW2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Elf3Q3UPW2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Elf3Q3UPW2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Elf3Q3UPW2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Elf3Q3UPW2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Elf3Q3UPW2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Elf3Q3UPW2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Elf3Q3UPW2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Elf3Q3UPW2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Elf3Q3UPW2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Elf3Q3UPW2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Elf3Q3UPW2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Elf3Q3UPW2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Elf3Q3UPW2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Elf3Q3UPW2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Elf3Q3UPW2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Elf3Q3UPW2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Elf3Q3UPW2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Elf3Q3UPW2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Elf3Q3UPW2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Elf3Q3UPW2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Elf3Q3UPW2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Elf3Q3UPW2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Elf3Q3UPW2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Elf3Q3UPW2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Elf3Q3UPW2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Elf3Q3UPW2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Elf3Q3UPW2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Elf3Q3UPW2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Elf3Q3UPW2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Elf3Q3UPW2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Elf3Q3UPW2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Elf3Q3UPW2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Elf3Q3UPW2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Elf3Q3UPW2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Elf3Q3UPW2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Elf3Q3UPW2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Elf3Q3UPW2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Elf3Q3UPW2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Elf3Q3UPW2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Elf3Q3UPW2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Elf3Q3UPW2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Elf3Q3UPW2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Elf3Q3UPW2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Elf3Q3UPW2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Elf3Q3UPW2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Elf3Q3UPW2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Elf3Q3UPW2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Elf3Q3UPW2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Elf3Q3UPW2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Elf3Q3UPW2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Elf3Q3UPW2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Elf3Q3UPW2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Elf3Q3UPW2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Elf3Q3UPW2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Elf3Q3UPW2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Elf3Q3UPW2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Elf3Q3UPW2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Elf3Q3UPW2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Elf3Q3UPW2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Elf3Q3UPW2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Elf3Q3UPW2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Elf3Q3UPW2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Elf3Q3UPW2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Elf3Q3UPW2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Elf3Q3UPW2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Elf3Q3UPW2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Elf3Q3UPW2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Elf3Q3UPW2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Elf3Q3UPW2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Elf3Q3UPW2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Elf3Q3UPW2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Elf3Q3UPW2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Elf3Q3UPW2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Elf3Q3UPW2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Elf3Q3UPW2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Elf3Q3UPW2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Elf3Q3UPW2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Elf3Q3UPW2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Elf3Q3UPW2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms