Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULA2

Btrc, F-box/WD repeat-containing protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BtrcQ3ULA2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BtrcQ3ULA2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BtrcQ3ULA2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BtrcQ3ULA2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BtrcQ3ULA2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BtrcQ3ULA2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BtrcQ3ULA2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BtrcQ3ULA2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BtrcQ3ULA2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BtrcQ3ULA2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BtrcQ3ULA2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BtrcQ3ULA2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BtrcQ3ULA2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BtrcQ3ULA2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BtrcQ3ULA2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BtrcQ3ULA2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BtrcQ3ULA2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BtrcQ3ULA2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BtrcQ3ULA2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BtrcQ3ULA2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BtrcQ3ULA2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BtrcQ3ULA2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BtrcQ3ULA2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BtrcQ3ULA2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BtrcQ3ULA2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BtrcQ3ULA2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BtrcQ3ULA2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BtrcQ3ULA2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BtrcQ3ULA2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BtrcQ3ULA2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BtrcQ3ULA2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BtrcQ3ULA2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BtrcQ3ULA2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BtrcQ3ULA2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BtrcQ3ULA2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
BtrcQ3ULA2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms