Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHH1

Zswim8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zswim8Q3UHH1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Zswim8Q3UHH1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Zswim8Q3UHH1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Zswim8Q3UHH1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zswim8Q3UHH1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zswim8Q3UHH1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zswim8Q3UHH1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zswim8Q3UHH1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zswim8Q3UHH1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zswim8Q3UHH1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zswim8Q3UHH1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zswim8Q3UHH1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zswim8Q3UHH1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zswim8Q3UHH1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zswim8Q3UHH1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zswim8Q3UHH1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Zswim8Q3UHH1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Zswim8Q3UHH1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Zswim8Q3UHH1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Zswim8Q3UHH1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Zswim8Q3UHH1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Zswim8Q3UHH1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Zswim8Q3UHH1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Zswim8Q3UHH1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Zswim8Q3UHH1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Zswim8Q3UHH1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Zswim8Q3UHH1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Zswim8Q3UHH1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zswim8Q3UHH1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Zswim8Q3UHH1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zswim8Q3UHH1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zswim8Q3UHH1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Zswim8Q3UHH1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Zswim8Q3UHH1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Zswim8Q3UHH1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Zswim8Q3UHH1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Zswim8Q3UHH1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Zswim8Q3UHH1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Zswim8Q3UHH1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Zswim8Q3UHH1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Zswim8Q3UHH1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Zswim8Q3UHH1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zswim8Q3UHH1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zswim8Q3UHH1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Zswim8Q3UHH1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Zswim8Q3UHH1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Zswim8Q3UHH1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Zswim8Q3UHH1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Zswim8Q3UHH1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Zswim8Q3UHH1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Zswim8Q3UHH1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Zswim8Q3UHH1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Zswim8Q3UHH1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Zswim8Q3UHH1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Zswim8Q3UHH1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Zswim8Q3UHH1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zswim8Q3UHH1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zswim8Q3UHH1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zswim8Q3UHH1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zswim8Q3UHH1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zswim8Q3UHH1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zswim8Q3UHH1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zswim8Q3UHH1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zswim8Q3UHH1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zswim8Q3UHH1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zswim8Q3UHH1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zswim8Q3UHH1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zswim8Q3UHH1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zswim8Q3UHH1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Zswim8Q3UHH1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zswim8Q3UHH1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zswim8Q3UHH1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Zswim8Q3UHH1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zswim8Q3UHH1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zswim8Q3UHH1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Zswim8Q3UHH1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zswim8Q3UHH1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zswim8Q3UHH1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zswim8Q3UHH1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zswim8Q3UHH1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zswim8Q3UHH1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zswim8Q3UHH1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Zswim8Q3UHH1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Zswim8Q3UHH1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zswim8Q3UHH1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zswim8Q3UHH1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zswim8Q3UHH1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zswim8Q3UHH1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zswim8Q3UHH1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zswim8Q3UHH1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zswim8Q3UHH1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zswim8Q3UHH1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Zswim8Q3UHH1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zswim8Q3UHH1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zswim8Q3UHH1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zswim8Q3UHH1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Zswim8Q3UHH1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zswim8Q3UHH1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zswim8Q3UHH1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zswim8Q3UHH1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms