Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc9Q3U0M1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc9Q3U0M1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc9Q3U0M1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc9Q3U0M1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc9Q3U0M1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc9Q3U0M1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc9Q3U0M1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc9Q3U0M1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc9Q3U0M1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc9Q3U0M1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc9Q3U0M1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc9Q3U0M1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc9Q3U0M1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc9Q3U0M1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc9Q3U0M1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc9Q3U0M1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc9Q3U0M1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc9Q3U0M1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc9Q3U0M1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc9Q3U0M1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc9Q3U0M1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc9Q3U0M1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc9Q3U0M1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc9Q3U0M1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc9Q3U0M1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc9Q3U0M1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc9Q3U0M1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc9Q3U0M1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc9Q3U0M1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc9Q3U0M1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trappc9Q3U0M1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc9Q3U0M1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trappc9Q3U0M1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc9Q3U0M1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc9Q3U0M1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc9Q3U0M1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc9Q3U0M1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc9Q3U0M1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc9Q3U0M1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc9Q3U0M1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc9Q3U0M1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc9Q3U0M1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc9Q3U0M1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc9Q3U0M1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc9Q3U0M1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc9Q3U0M1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc9Q3U0M1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc9Q3U0M1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc9Q3U0M1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Trappc9Q3U0M1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc9Q3U0M1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc9Q3U0M1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc9Q3U0M1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc9Q3U0M1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc9Q3U0M1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc9Q3U0M1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc9Q3U0M1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc9Q3U0M1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc9Q3U0M1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc9Q3U0M1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc9Q3U0M1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc9Q3U0M1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc9Q3U0M1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc9Q3U0M1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc9Q3U0M1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc9Q3U0M1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc9Q3U0M1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc9Q3U0M1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc9Q3U0M1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc9Q3U0M1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc9Q3U0M1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc9Q3U0M1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc9Q3U0M1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc9Q3U0M1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc9Q3U0M1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc9Q3U0M1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc9Q3U0M1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc9Q3U0M1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc9Q3U0M1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc9Q3U0M1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc9Q3U0M1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc9Q3U0M1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc9Q3U0M1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc9Q3U0M1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc9Q3U0M1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc9Q3U0M1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc9Q3U0M1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc9Q3U0M1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc9Q3U0M1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc9Q3U0M1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc9Q3U0M1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc9Q3U0M1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc9Q3U0M1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc9Q3U0M1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc9Q3U0M1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc9Q3U0M1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc9Q3U0M1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc9Q3U0M1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc9Q3U0M1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms