Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21440Q3TTD8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21440Q3TTD8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms