Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctdnep1Q3TP92 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctdnep1Q3TP92 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctdnep1Q3TP92 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctdnep1Q3TP92 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctdnep1Q3TP92 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctdnep1Q3TP92 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctdnep1Q3TP92 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctdnep1Q3TP92 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctdnep1Q3TP92 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctdnep1Q3TP92 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctdnep1Q3TP92 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctdnep1Q3TP92 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctdnep1Q3TP92 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctdnep1Q3TP92 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctdnep1Q3TP92 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctdnep1Q3TP92 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctdnep1Q3TP92 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctdnep1Q3TP92 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctdnep1Q3TP92 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctdnep1Q3TP92 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctdnep1Q3TP92 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctdnep1Q3TP92 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctdnep1Q3TP92 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctdnep1Q3TP92 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ctdnep1Q3TP92 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ctdnep1Q3TP92 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ctdnep1Q3TP92 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ctdnep1Q3TP92 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ctdnep1Q3TP92 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ctdnep1Q3TP92 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ctdnep1Q3TP92 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ctdnep1Q3TP92 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ctdnep1Q3TP92 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctdnep1Q3TP92 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctdnep1Q3TP92 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctdnep1Q3TP92 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctdnep1Q3TP92 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctdnep1Q3TP92 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctdnep1Q3TP92 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctdnep1Q3TP92 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctdnep1Q3TP92 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctdnep1Q3TP92 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctdnep1Q3TP92 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctdnep1Q3TP92 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctdnep1Q3TP92 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctdnep1Q3TP92 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctdnep1Q3TP92 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctdnep1Q3TP92 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctdnep1Q3TP92 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ctdnep1Q3TP92 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ctdnep1Q3TP92 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ctdnep1Q3TP92 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ctdnep1Q3TP92 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ctdnep1Q3TP92 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctdnep1Q3TP92 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctdnep1Q3TP92 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctdnep1Q3TP92 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctdnep1Q3TP92 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctdnep1Q3TP92 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctdnep1Q3TP92 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctdnep1Q3TP92 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctdnep1Q3TP92 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctdnep1Q3TP92 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctdnep1Q3TP92 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ctdnep1Q3TP92 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctdnep1Q3TP92 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctdnep1Q3TP92 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctdnep1Q3TP92 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctdnep1Q3TP92 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctdnep1Q3TP92 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctdnep1Q3TP92 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctdnep1Q3TP92 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctdnep1Q3TP92 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctdnep1Q3TP92 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctdnep1Q3TP92 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctdnep1Q3TP92 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctdnep1Q3TP92 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctdnep1Q3TP92 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctdnep1Q3TP92 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctdnep1Q3TP92 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctdnep1Q3TP92 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctdnep1Q3TP92 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctdnep1Q3TP92 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctdnep1Q3TP92 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctdnep1Q3TP92 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctdnep1Q3TP92 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctdnep1Q3TP92 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctdnep1Q3TP92 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctdnep1Q3TP92 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctdnep1Q3TP92 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctdnep1Q3TP92 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctdnep1Q3TP92 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctdnep1Q3TP92 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctdnep1Q3TP92 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctdnep1Q3TP92 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctdnep1Q3TP92 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctdnep1Q3TP92 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctdnep1Q3TP92 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms