Protein–RNA interactions for Protein: Q32NY4

Cnnm3, Metal transporter CNNM3, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm3Q32NY4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnnm3Q32NY4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cnnm3Q32NY4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnnm3Q32NY4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnnm3Q32NY4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnnm3Q32NY4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnnm3Q32NY4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnnm3Q32NY4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnnm3Q32NY4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnnm3Q32NY4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnnm3Q32NY4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnnm3Q32NY4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnnm3Q32NY4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnnm3Q32NY4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnnm3Q32NY4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnnm3Q32NY4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnnm3Q32NY4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnnm3Q32NY4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnnm3Q32NY4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnnm3Q32NY4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnnm3Q32NY4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnnm3Q32NY4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnnm3Q32NY4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnnm3Q32NY4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnnm3Q32NY4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnnm3Q32NY4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnnm3Q32NY4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnnm3Q32NY4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnnm3Q32NY4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnnm3Q32NY4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnnm3Q32NY4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnnm3Q32NY4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnnm3Q32NY4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnnm3Q32NY4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnnm3Q32NY4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnnm3Q32NY4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnnm3Q32NY4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnnm3Q32NY4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnnm3Q32NY4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnnm3Q32NY4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnnm3Q32NY4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnnm3Q32NY4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnnm3Q32NY4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnnm3Q32NY4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnnm3Q32NY4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnnm3Q32NY4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnnm3Q32NY4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnnm3Q32NY4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cnnm3Q32NY4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cnnm3Q32NY4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cnnm3Q32NY4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cnnm3Q32NY4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cnnm3Q32NY4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnnm3Q32NY4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnnm3Q32NY4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnnm3Q32NY4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnnm3Q32NY4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnnm3Q32NY4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnnm3Q32NY4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnnm3Q32NY4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnnm3Q32NY4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnnm3Q32NY4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnnm3Q32NY4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnnm3Q32NY4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnnm3Q32NY4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnnm3Q32NY4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnnm3Q32NY4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnnm3Q32NY4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnnm3Q32NY4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnnm3Q32NY4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnnm3Q32NY4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnnm3Q32NY4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnnm3Q32NY4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnnm3Q32NY4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnnm3Q32NY4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnnm3Q32NY4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnnm3Q32NY4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnnm3Q32NY4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnnm3Q32NY4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnnm3Q32NY4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cnnm3Q32NY4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cnnm3Q32NY4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cnnm3Q32NY4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cnnm3Q32NY4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cnnm3Q32NY4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cnnm3Q32NY4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cnnm3Q32NY4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cnnm3Q32NY4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cnnm3Q32NY4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cnnm3Q32NY4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cnnm3Q32NY4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cnnm3Q32NY4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cnnm3Q32NY4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cnnm3Q32NY4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnnm3Q32NY4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnnm3Q32NY4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnnm3Q32NY4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnnm3Q32NY4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnnm3Q32NY4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnnm3Q32NY4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms