Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc162pQ0VG85 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ccdc162pQ0VG85 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc162pQ0VG85 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc162pQ0VG85 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc162pQ0VG85 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc162pQ0VG85 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc162pQ0VG85 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc162pQ0VG85 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc162pQ0VG85 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc162pQ0VG85 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc162pQ0VG85 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc162pQ0VG85 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc162pQ0VG85 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc162pQ0VG85 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc162pQ0VG85 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc162pQ0VG85 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc162pQ0VG85 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc162pQ0VG85 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc162pQ0VG85 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc162pQ0VG85 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc162pQ0VG85 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc162pQ0VG85 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc162pQ0VG85 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc162pQ0VG85 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc162pQ0VG85 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc162pQ0VG85 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc162pQ0VG85 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc162pQ0VG85 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc162pQ0VG85 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc162pQ0VG85 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc162pQ0VG85 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc162pQ0VG85 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc162pQ0VG85 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc162pQ0VG85 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc162pQ0VG85 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc162pQ0VG85 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc162pQ0VG85 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc162pQ0VG85 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc162pQ0VG85 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc162pQ0VG85 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc162pQ0VG85 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc162pQ0VG85 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc162pQ0VG85 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc162pQ0VG85 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc162pQ0VG85 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc162pQ0VG85 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc162pQ0VG85 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc162pQ0VG85 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc162pQ0VG85 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc162pQ0VG85 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc162pQ0VG85 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc162pQ0VG85 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc162pQ0VG85 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc162pQ0VG85 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc162pQ0VG85 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc162pQ0VG85 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc162pQ0VG85 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc162pQ0VG85 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc162pQ0VG85 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc162pQ0VG85 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc162pQ0VG85 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc162pQ0VG85 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc162pQ0VG85 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc162pQ0VG85 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc162pQ0VG85 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc162pQ0VG85 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc162pQ0VG85 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc162pQ0VG85 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc162pQ0VG85 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc162pQ0VG85 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc162pQ0VG85 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc162pQ0VG85 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc162pQ0VG85 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc162pQ0VG85 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc162pQ0VG85 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc162pQ0VG85 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc162pQ0VG85 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc162pQ0VG85 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc162pQ0VG85 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc162pQ0VG85 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc162pQ0VG85 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc162pQ0VG85 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc162pQ0VG85 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc162pQ0VG85 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc162pQ0VG85 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc162pQ0VG85 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc162pQ0VG85 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc162pQ0VG85 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc162pQ0VG85 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc162pQ0VG85 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc162pQ0VG85 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc162pQ0VG85 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc162pQ0VG85 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc162pQ0VG85 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc162pQ0VG85 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc162pQ0VG85 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc162pQ0VG85 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc162pQ0VG85 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc162pQ0VG85 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms