Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcnb1Q03717 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcnb1Q03717 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcnb1Q03717 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnb1Q03717 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnb1Q03717 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnb1Q03717 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnb1Q03717 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnb1Q03717 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnb1Q03717 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnb1Q03717 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kcnb1Q03717 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kcnb1Q03717 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kcnb1Q03717 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kcnb1Q03717 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kcnb1Q03717 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kcnb1Q03717 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kcnb1Q03717 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kcnb1Q03717 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kcnb1Q03717 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Kcnb1Q03717 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcnb1Q03717 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnb1Q03717 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnb1Q03717 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnb1Q03717 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnb1Q03717 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnb1Q03717 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnb1Q03717 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnb1Q03717 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnb1Q03717 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnb1Q03717 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnb1Q03717 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnb1Q03717 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnb1Q03717 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnb1Q03717 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnb1Q03717 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnb1Q03717 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnb1Q03717 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnb1Q03717 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnb1Q03717 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnb1Q03717 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnb1Q03717 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnb1Q03717 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnb1Q03717 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms