Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vgll3P85442 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Vgll3P85442 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vgll3P85442 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vgll3P85442 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vgll3P85442 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vgll3P85442 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vgll3P85442 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vgll3P85442 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vgll3P85442 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Vgll3P85442 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Vgll3P85442 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vgll3P85442 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vgll3P85442 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Vgll3P85442 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vgll3P85442 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vgll3P85442 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vgll3P85442 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vgll3P85442 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vgll3P85442 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vgll3P85442 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vgll3P85442 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vgll3P85442 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vgll3P85442 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vgll3P85442 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vgll3P85442 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vgll3P85442 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vgll3P85442 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vgll3P85442 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vgll3P85442 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vgll3P85442 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vgll3P85442 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Vgll3P85442 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vgll3P85442 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vgll3P85442 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vgll3P85442 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vgll3P85442 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vgll3P85442 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vgll3P85442 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vgll3P85442 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vgll3P85442 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vgll3P85442 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vgll3P85442 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vgll3P85442 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vgll3P85442 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vgll3P85442 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vgll3P85442 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vgll3P85442 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vgll3P85442 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vgll3P85442 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vgll3P85442 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vgll3P85442 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vgll3P85442 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vgll3P85442 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vgll3P85442 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vgll3P85442 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vgll3P85442 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vgll3P85442 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vgll3P85442 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vgll3P85442 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vgll3P85442 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vgll3P85442 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vgll3P85442 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vgll3P85442 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vgll3P85442 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vgll3P85442 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vgll3P85442 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vgll3P85442 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vgll3P85442 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vgll3P85442 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vgll3P85442 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vgll3P85442 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vgll3P85442 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vgll3P85442 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vgll3P85442 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vgll3P85442 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vgll3P85442 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vgll3P85442 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vgll3P85442 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vgll3P85442 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vgll3P85442 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vgll3P85442 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Vgll3P85442 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vgll3P85442 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vgll3P85442 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vgll3P85442 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vgll3P85442 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vgll3P85442 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149 ms