Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P58686 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P58686 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
P58686 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P58686 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P58686 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
P58686 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P58686 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P58686 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P58686 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P58686 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
P58686 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P58686 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P58686 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P58686 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
P58686 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
P58686 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P58686 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
P58686 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
P58686 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P58686 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
P58686 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
P58686 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P58686 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P58686 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P58686 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P58686 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P58686 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P58686 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P58686 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
P58686 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P58686 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P58686 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P58686 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
P58686 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
P58686 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P58686 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
P58686 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
P58686 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P58686 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
P58686 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
P58686 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P58686 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P58686 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P58686 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P58686 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P58686 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P58686 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P58686 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P58686 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P58686 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P58686 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P58686 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P58686 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P58686 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P58686 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P58686 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
P58686 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P58686 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P58686 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P58686 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P58686 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
P58686 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P58686 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P58686 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
P58686 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P58686 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P58686 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
P58686 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
P58686 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
P58686 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P58686 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P58686 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
P58686 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
P58686 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
P58686 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
P58686 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P58686 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P58686 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P58686 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
P58686 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P58686 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
P58686 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
P58686 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P58686 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P58686 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P58686 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
P58686 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
P58686 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
P58686 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P58686 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P58686 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P58686 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P58686 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
P58686 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P58686 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
P58686 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P58686 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
P58686 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P58686 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms