Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Irf5P56477 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irf5P56477 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irf5P56477 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irf5P56477 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irf5P56477 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irf5P56477 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irf5P56477 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irf5P56477 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irf5P56477 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Irf5P56477 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irf5P56477 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irf5P56477 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Irf5P56477 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irf5P56477 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Irf5P56477 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Irf5P56477 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irf5P56477 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irf5P56477 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Irf5P56477 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Irf5P56477 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Irf5P56477 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Irf5P56477 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Irf5P56477 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Irf5P56477 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Irf5P56477 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Irf5P56477 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Irf5P56477 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irf5P56477 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irf5P56477 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irf5P56477 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irf5P56477 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Irf5P56477 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irf5P56477 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irf5P56477 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irf5P56477 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irf5P56477 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Irf5P56477 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Irf5P56477 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Irf5P56477 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Irf5P56477 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Irf5P56477 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Irf5P56477 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Irf5P56477 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irf5P56477 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Irf5P56477 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irf5P56477 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irf5P56477 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irf5P56477 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irf5P56477 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irf5P56477 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irf5P56477 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irf5P56477 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irf5P56477 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irf5P56477 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irf5P56477 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irf5P56477 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irf5P56477 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irf5P56477 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irf5P56477 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irf5P56477 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irf5P56477 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Irf5P56477 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irf5P56477 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Irf5P56477 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Irf5P56477 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Irf5P56477 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Irf5P56477 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irf5P56477 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irf5P56477 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irf5P56477 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irf5P56477 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irf5P56477 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irf5P56477 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irf5P56477 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irf5P56477 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irf5P56477 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irf5P56477 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irf5P56477 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irf5P56477 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irf5P56477 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Irf5P56477 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Irf5P56477 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Irf5P56477 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Irf5P56477 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Irf5P56477 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Irf5P56477 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irf5P56477 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irf5P56477 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irf5P56477 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irf5P56477 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irf5P56477 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irf5P56477 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irf5P56477 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irf5P56477 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irf5P56477 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irf5P56477 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irf5P56477 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irf5P56477 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irf5P56477 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms