Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CdaP56389 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CdaP56389 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CdaP56389 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CdaP56389 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CdaP56389 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CdaP56389 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CdaP56389 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CdaP56389 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CdaP56389 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CdaP56389 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CdaP56389 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CdaP56389 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CdaP56389 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CdaP56389 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CdaP56389 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CdaP56389 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CdaP56389 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CdaP56389 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CdaP56389 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CdaP56389 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CdaP56389 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CdaP56389 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CdaP56389 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CdaP56389 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CdaP56389 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CdaP56389 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CdaP56389 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CdaP56389 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CdaP56389 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CdaP56389 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CdaP56389 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CdaP56389 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CdaP56389 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CdaP56389 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CdaP56389 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CdaP56389 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CdaP56389 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CdaP56389 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CdaP56389 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CdaP56389 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CdaP56389 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CdaP56389 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CdaP56389 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CdaP56389 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CdaP56389 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CdaP56389 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CdaP56389 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CdaP56389 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CdaP56389 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CdaP56389 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CdaP56389 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CdaP56389 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CdaP56389 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CdaP56389 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CdaP56389 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CdaP56389 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CdaP56389 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CdaP56389 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CdaP56389 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CdaP56389 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CdaP56389 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CdaP56389 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CdaP56389 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CdaP56389 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CdaP56389 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CdaP56389 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CdaP56389 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CdaP56389 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CdaP56389 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CdaP56389 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CdaP56389 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CdaP56389 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CdaP56389 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CdaP56389 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CdaP56389 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CdaP56389 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CdaP56389 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CdaP56389 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CdaP56389 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CdaP56389 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CdaP56389 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CdaP56389 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CdaP56389 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CdaP56389 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CdaP56389 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CdaP56389 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CdaP56389 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CdaP56389 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CdaP56389 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CdaP56389 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CdaP56389 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CdaP56389 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CdaP56389 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CdaP56389 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CdaP56389 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CdaP56389 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CdaP56389 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CdaP56389 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CdaP56389 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms