Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RabggtbP53612 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RabggtbP53612 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RabggtbP53612 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RabggtbP53612 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RabggtbP53612 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RabggtbP53612 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RabggtbP53612 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RabggtbP53612 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RabggtbP53612 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RabggtbP53612 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RabggtbP53612 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RabggtbP53612 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RabggtbP53612 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RabggtbP53612 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RabggtbP53612 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RabggtbP53612 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RabggtbP53612 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RabggtbP53612 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RabggtbP53612 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RabggtbP53612 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RabggtbP53612 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RabggtbP53612 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RabggtbP53612 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RabggtbP53612 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RabggtbP53612 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RabggtbP53612 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RabggtbP53612 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RabggtbP53612 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RabggtbP53612 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RabggtbP53612 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RabggtbP53612 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RabggtbP53612 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RabggtbP53612 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RabggtbP53612 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RabggtbP53612 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RabggtbP53612 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RabggtbP53612 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RabggtbP53612 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RabggtbP53612 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RabggtbP53612 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RabggtbP53612 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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