Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
XpcP51612 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
XpcP51612 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
XpcP51612 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
XpcP51612 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
XpcP51612 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
XpcP51612 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
XpcP51612 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
XpcP51612 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
XpcP51612 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
XpcP51612 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
XpcP51612 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
XpcP51612 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
XpcP51612 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
XpcP51612 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
XpcP51612 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
XpcP51612 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
XpcP51612 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
XpcP51612 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
XpcP51612 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
XpcP51612 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
XpcP51612 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
XpcP51612 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
XpcP51612 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
XpcP51612 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
XpcP51612 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
XpcP51612 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
XpcP51612 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
XpcP51612 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
XpcP51612 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
XpcP51612 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
XpcP51612 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XpcP51612 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XpcP51612 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
XpcP51612 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
XpcP51612 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
XpcP51612 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XpcP51612 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
XpcP51612 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
XpcP51612 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
XpcP51612 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
XpcP51612 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
XpcP51612 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
XpcP51612 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
XpcP51612 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
XpcP51612 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
XpcP51612 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
XpcP51612 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
XpcP51612 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
XpcP51612 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
XpcP51612 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
XpcP51612 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
XpcP51612 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
XpcP51612 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
XpcP51612 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
XpcP51612 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
XpcP51612 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
XpcP51612 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
XpcP51612 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
XpcP51612 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
XpcP51612 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
XpcP51612 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
XpcP51612 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
XpcP51612 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
XpcP51612 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
XpcP51612 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
XpcP51612 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
XpcP51612 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
XpcP51612 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
XpcP51612 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
XpcP51612 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
XpcP51612 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
XpcP51612 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
XpcP51612 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
XpcP51612 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
XpcP51612 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
XpcP51612 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
XpcP51612 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XpcP51612 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XpcP51612 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
XpcP51612 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XpcP51612 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XpcP51612 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XpcP51612 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
XpcP51612 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XpcP51612 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
XpcP51612 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XpcP51612 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XpcP51612 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
XpcP51612 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XpcP51612 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
XpcP51612 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XpcP51612 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XpcP51612 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
XpcP51612 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XpcP51612 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XpcP51612 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XpcP51612 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XpcP51612 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XpcP51612 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms