Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FmodP50608 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FmodP50608 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FmodP50608 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FmodP50608 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FmodP50608 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FmodP50608 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FmodP50608 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
FmodP50608 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FmodP50608 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FmodP50608 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FmodP50608 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FmodP50608 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FmodP50608 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FmodP50608 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FmodP50608 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FmodP50608 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FmodP50608 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FmodP50608 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FmodP50608 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FmodP50608 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FmodP50608 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FmodP50608 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FmodP50608 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FmodP50608 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FmodP50608 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FmodP50608 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FmodP50608 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FmodP50608 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FmodP50608 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FmodP50608 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FmodP50608 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FmodP50608 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FmodP50608 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FmodP50608 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FmodP50608 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FmodP50608 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FmodP50608 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FmodP50608 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FmodP50608 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FmodP50608 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FmodP50608 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FmodP50608 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FmodP50608 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FmodP50608 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FmodP50608 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FmodP50608 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FmodP50608 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FmodP50608 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FmodP50608 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FmodP50608 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FmodP50608 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FmodP50608 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FmodP50608 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FmodP50608 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FmodP50608 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FmodP50608 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FmodP50608 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FmodP50608 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FmodP50608 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FmodP50608 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FmodP50608 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FmodP50608 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FmodP50608 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FmodP50608 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FmodP50608 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FmodP50608 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FmodP50608 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FmodP50608 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FmodP50608 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FmodP50608 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FmodP50608 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FmodP50608 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FmodP50608 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FmodP50608 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FmodP50608 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FmodP50608 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FmodP50608 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FmodP50608 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FmodP50608 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FmodP50608 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FmodP50608 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FmodP50608 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FmodP50608 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FmodP50608 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FmodP50608 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FmodP50608 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FmodP50608 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FmodP50608 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FmodP50608 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FmodP50608 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FmodP50608 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FmodP50608 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FmodP50608 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FmodP50608 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FmodP50608 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FmodP50608 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FmodP50608 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FmodP50608 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FmodP50608 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms