Protein–RNA interactions for Protein: P50446

Krt6a, Keratin, type II cytoskeletal 6A, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6aP50446 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt6aP50446 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt6aP50446 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt6aP50446 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt6aP50446 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt6aP50446 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt6aP50446 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt6aP50446 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt6aP50446 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt6aP50446 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt6aP50446 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt6aP50446 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt6aP50446 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt6aP50446 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt6aP50446 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt6aP50446 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt6aP50446 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt6aP50446 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt6aP50446 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt6aP50446 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt6aP50446 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt6aP50446 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt6aP50446 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Krt6aP50446 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Krt6aP50446 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt6aP50446 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt6aP50446 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt6aP50446 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt6aP50446 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt6aP50446 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt6aP50446 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt6aP50446 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt6aP50446 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt6aP50446 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt6aP50446 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt6aP50446 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms