Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LtbrP50284 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LtbrP50284 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LtbrP50284 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LtbrP50284 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LtbrP50284 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LtbrP50284 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LtbrP50284 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LtbrP50284 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LtbrP50284 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LtbrP50284 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LtbrP50284 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LtbrP50284 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LtbrP50284 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LtbrP50284 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LtbrP50284 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LtbrP50284 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LtbrP50284 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LtbrP50284 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LtbrP50284 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LtbrP50284 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LtbrP50284 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LtbrP50284 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LtbrP50284 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LtbrP50284 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LtbrP50284 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LtbrP50284 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LtbrP50284 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LtbrP50284 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LtbrP50284 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LtbrP50284 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LtbrP50284 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LtbrP50284 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LtbrP50284 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LtbrP50284 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LtbrP50284 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LtbrP50284 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LtbrP50284 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LtbrP50284 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LtbrP50284 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LtbrP50284 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LtbrP50284 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LtbrP50284 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LtbrP50284 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LtbrP50284 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LtbrP50284 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LtbrP50284 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LtbrP50284 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LtbrP50284 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LtbrP50284 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LtbrP50284 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LtbrP50284 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LtbrP50284 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LtbrP50284 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LtbrP50284 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LtbrP50284 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LtbrP50284 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LtbrP50284 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LtbrP50284 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LtbrP50284 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LtbrP50284 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LtbrP50284 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LtbrP50284 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LtbrP50284 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LtbrP50284 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LtbrP50284 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LtbrP50284 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LtbrP50284 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LtbrP50284 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LtbrP50284 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LtbrP50284 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LtbrP50284 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LtbrP50284 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LtbrP50284 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LtbrP50284 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LtbrP50284 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LtbrP50284 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LtbrP50284 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LtbrP50284 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LtbrP50284 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LtbrP50284 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LtbrP50284 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LtbrP50284 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LtbrP50284 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LtbrP50284 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LtbrP50284 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LtbrP50284 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LtbrP50284 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LtbrP50284 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LtbrP50284 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LtbrP50284 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LtbrP50284 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LtbrP50284 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LtbrP50284 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LtbrP50284 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LtbrP50284 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LtbrP50284 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LtbrP50284 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LtbrP50284 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LtbrP50284 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms