Protein–RNA interactions for Protein: P42703

Lifr, Leukemia inhibitory factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,092 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LifrP42703 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LifrP42703 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LifrP42703 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LifrP42703 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LifrP42703 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LifrP42703 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LifrP42703 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LifrP42703 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LifrP42703 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LifrP42703 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LifrP42703 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LifrP42703 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LifrP42703 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LifrP42703 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LifrP42703 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LifrP42703 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LifrP42703 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LifrP42703 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LifrP42703 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LifrP42703 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LifrP42703 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LifrP42703 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LifrP42703 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LifrP42703 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LifrP42703 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LifrP42703 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LifrP42703 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LifrP42703 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LifrP42703 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LifrP42703 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LifrP42703 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LifrP42703 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LifrP42703 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LifrP42703 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LifrP42703 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LifrP42703 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LifrP42703 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LifrP42703 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LifrP42703 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LifrP42703 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LifrP42703 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LifrP42703 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LifrP42703 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LifrP42703 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LifrP42703 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LifrP42703 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LifrP42703 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LifrP42703 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LifrP42703 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LifrP42703 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LifrP42703 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LifrP42703 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LifrP42703 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LifrP42703 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LifrP42703 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LifrP42703 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LifrP42703 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LifrP42703 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LifrP42703 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LifrP42703 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LifrP42703 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LifrP42703 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LifrP42703 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LifrP42703 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LifrP42703 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LifrP42703 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LifrP42703 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LifrP42703 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LifrP42703 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LifrP42703 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LifrP42703 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LifrP42703 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LifrP42703 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LifrP42703 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LifrP42703 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LifrP42703 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LifrP42703 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LifrP42703 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LifrP42703 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LifrP42703 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LifrP42703 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LifrP42703 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LifrP42703 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LifrP42703 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LifrP42703 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LifrP42703 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LifrP42703 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LifrP42703 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LifrP42703 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LifrP42703 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LifrP42703 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LifrP42703 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LifrP42703 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LifrP42703 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LifrP42703 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LifrP42703 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LifrP42703 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LifrP42703 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LifrP42703 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LifrP42703 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms