Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nkx1-2P42580 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nkx1-2P42580 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nkx1-2P42580 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nkx1-2P42580 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nkx1-2P42580 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nkx1-2P42580 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nkx1-2P42580 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nkx1-2P42580 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nkx1-2P42580 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nkx1-2P42580 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nkx1-2P42580 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nkx1-2P42580 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nkx1-2P42580 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nkx1-2P42580 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nkx1-2P42580 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nkx1-2P42580 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nkx1-2P42580 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nkx1-2P42580 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nkx1-2P42580 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nkx1-2P42580 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nkx1-2P42580 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nkx1-2P42580 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nkx1-2P42580 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nkx1-2P42580 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nkx1-2P42580 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nkx1-2P42580 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nkx1-2P42580 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nkx1-2P42580 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nkx1-2P42580 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Nkx1-2P42580 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nkx1-2P42580 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nkx1-2P42580 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nkx1-2P42580 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nkx1-2P42580 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nkx1-2P42580 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Nkx1-2P42580 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nkx1-2P42580 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nkx1-2P42580 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nkx1-2P42580 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nkx1-2P42580 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nkx1-2P42580 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Nkx1-2P42580 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nkx1-2P42580 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nkx1-2P42580 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nkx1-2P42580 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nkx1-2P42580 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nkx1-2P42580 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nkx1-2P42580 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nkx1-2P42580 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nkx1-2P42580 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nkx1-2P42580 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Nkx1-2P42580 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nkx1-2P42580 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nkx1-2P42580 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nkx1-2P42580 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nkx1-2P42580 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nkx1-2P42580 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nkx1-2P42580 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Nkx1-2P42580 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nkx1-2P42580 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nkx1-2P42580 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nkx1-2P42580 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nkx1-2P42580 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nkx1-2P42580 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nkx1-2P42580 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nkx1-2P42580 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nkx1-2P42580 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nkx1-2P42580 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nkx1-2P42580 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nkx1-2P42580 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nkx1-2P42580 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nkx1-2P42580 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nkx1-2P42580 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nkx1-2P42580 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nkx1-2P42580 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nkx1-2P42580 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nkx1-2P42580 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nkx1-2P42580 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nkx1-2P42580 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Nkx1-2P42580 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nkx1-2P42580 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nkx1-2P42580 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nkx1-2P42580 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nkx1-2P42580 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nkx1-2P42580 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nkx1-2P42580 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nkx1-2P42580 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Nkx1-2P42580 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nkx1-2P42580 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nkx1-2P42580 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nkx1-2P42580 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nkx1-2P42580 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nkx1-2P42580 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nkx1-2P42580 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Nkx1-2P42580 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nkx1-2P42580 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nkx1-2P42580 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nkx1-2P42580 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Nkx1-2P42580 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms