Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vav1P27870 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vav1P27870 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vav1P27870 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vav1P27870 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Vav1P27870 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vav1P27870 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vav1P27870 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vav1P27870 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vav1P27870 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vav1P27870 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vav1P27870 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vav1P27870 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vav1P27870 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Vav1P27870 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vav1P27870 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Vav1P27870 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vav1P27870 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vav1P27870 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Vav1P27870 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Vav1P27870 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vav1P27870 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vav1P27870 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vav1P27870 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vav1P27870 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vav1P27870 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vav1P27870 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vav1P27870 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vav1P27870 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vav1P27870 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vav1P27870 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vav1P27870 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vav1P27870 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vav1P27870 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vav1P27870 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vav1P27870 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vav1P27870 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vav1P27870 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vav1P27870 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vav1P27870 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vav1P27870 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vav1P27870 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vav1P27870 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vav1P27870 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vav1P27870 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vav1P27870 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vav1P27870 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vav1P27870 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vav1P27870 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vav1P27870 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vav1P27870 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vav1P27870 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vav1P27870 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vav1P27870 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vav1P27870 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vav1P27870 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vav1P27870 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vav1P27870 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vav1P27870 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vav1P27870 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vav1P27870 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vav1P27870 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vav1P27870 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vav1P27870 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vav1P27870 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Vav1P27870 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vav1P27870 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vav1P27870 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Vav1P27870 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Vav1P27870 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vav1P27870 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vav1P27870 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vav1P27870 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vav1P27870 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vav1P27870 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Vav1P27870 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vav1P27870 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vav1P27870 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vav1P27870 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vav1P27870 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vav1P27870 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vav1P27870 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vav1P27870 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vav1P27870 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vav1P27870 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vav1P27870 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vav1P27870 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Vav1P27870 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vav1P27870 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vav1P27870 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vav1P27870 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vav1P27870 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Vav1P27870 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vav1P27870 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vav1P27870 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vav1P27870 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vav1P27870 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vav1P27870 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vav1P27870 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vav1P27870 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms