Protein–RNA interactions for Protein: P22646

Cd3e, T-cell surface glycoprotein CD3 epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eP22646 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd3eP22646 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd3eP22646 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd3eP22646 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd3eP22646 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd3eP22646 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd3eP22646 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd3eP22646 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd3eP22646 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd3eP22646 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd3eP22646 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd3eP22646 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd3eP22646 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd3eP22646 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd3eP22646 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd3eP22646 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd3eP22646 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd3eP22646 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd3eP22646 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd3eP22646 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd3eP22646 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd3eP22646 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd3eP22646 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd3eP22646 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd3eP22646 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd3eP22646 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd3eP22646 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd3eP22646 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd3eP22646 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd3eP22646 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd3eP22646 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd3eP22646 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd3eP22646 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd3eP22646 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd3eP22646 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms