Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ms4a2P20490 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ms4a2P20490 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ms4a2P20490 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ms4a2P20490 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ms4a2P20490 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ms4a2P20490 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ms4a2P20490 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ms4a2P20490 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ms4a2P20490 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ms4a2P20490 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ms4a2P20490 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ms4a2P20490 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ms4a2P20490 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ms4a2P20490 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ms4a2P20490 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ms4a2P20490 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ms4a2P20490 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ms4a2P20490 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ms4a2P20490 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ms4a2P20490 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ms4a2P20490 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ms4a2P20490 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ms4a2P20490 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ms4a2P20490 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ms4a2P20490 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ms4a2P20490 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ms4a2P20490 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ms4a2P20490 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ms4a2P20490 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ms4a2P20490 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ms4a2P20490 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ms4a2P20490 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ms4a2P20490 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ms4a2P20490 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ms4a2P20490 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ms4a2P20490 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ms4a2P20490 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ms4a2P20490 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms