Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

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Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PolP10400 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PolP10400 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PolP10400 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PolP10400 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PolP10400 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PolP10400 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PolP10400 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PolP10400 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PolP10400 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PolP10400 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PolP10400 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PolP10400 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PolP10400 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PolP10400 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PolP10400 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PolP10400 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PolP10400 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PolP10400 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PolP10400 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PolP10400 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PolP10400 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PolP10400 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PolP10400 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PolP10400 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PolP10400 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PolP10400 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PolP10400 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PolP10400 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PolP10400 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PolP10400 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PolP10400 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PolP10400 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PolP10400 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PolP10400 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PolP10400 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PolP10400 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PolP10400 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PolP10400 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PolP10400 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PolP10400 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PolP10400 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PolP10400 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PolP10400 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PolP10400 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PolP10400 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PolP10400 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PolP10400 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PolP10400 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PolP10400 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PolP10400 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PolP10400 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PolP10400 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PolP10400 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PolP10400 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PolP10400 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PolP10400 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PolP10400 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PolP10400 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PolP10400 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PolP10400 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PolP10400 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PolP10400 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PolP10400 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PolP10400 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PolP10400 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PolP10400 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PolP10400 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PolP10400 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PolP10400 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PolP10400 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PolP10400 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PolP10400 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PolP10400 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PolP10400 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PolP10400 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PolP10400 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PolP10400 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PolP10400 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PolP10400 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PolP10400 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PolP10400 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PolP10400 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PolP10400 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PolP10400 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PolP10400 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PolP10400 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PolP10400 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PolP10400 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PolP10400 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PolP10400 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PolP10400 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PolP10400 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
PolP10400 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PolP10400 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PolP10400 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PolP10400 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PolP10400 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PolP10400 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PolP10400 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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