Protein–RNA interactions for Protein: P0CW03

Ly6c2, Lymphocyte antigen 6C2, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c2P0CW03 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ly6c2P0CW03 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms