Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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