Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NefmP08553 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NefmP08553 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NefmP08553 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NefmP08553 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NefmP08553 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NefmP08553 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NefmP08553 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NefmP08553 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NefmP08553 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NefmP08553 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NefmP08553 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NefmP08553 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NefmP08553 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NefmP08553 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NefmP08553 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NefmP08553 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
NefmP08553 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NefmP08553 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NefmP08553 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
NefmP08553 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NefmP08553 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NefmP08553 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NefmP08553 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NefmP08553 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NefmP08553 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NefmP08553 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NefmP08553 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NefmP08553 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NefmP08553 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NefmP08553 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NefmP08553 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NefmP08553 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NefmP08553 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NefmP08553 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NefmP08553 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NefmP08553 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NefmP08553 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NefmP08553 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NefmP08553 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NefmP08553 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NefmP08553 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NefmP08553 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NefmP08553 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NefmP08553 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NefmP08553 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
NefmP08553 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NefmP08553 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NefmP08553 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
NefmP08553 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NefmP08553 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NefmP08553 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NefmP08553 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NefmP08553 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NefmP08553 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NefmP08553 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NefmP08553 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NefmP08553 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NefmP08553 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NefmP08553 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NefmP08553 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NefmP08553 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NefmP08553 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
NefmP08553 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NefmP08553 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NefmP08553 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NefmP08553 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NefmP08553 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NefmP08553 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NefmP08553 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NefmP08553 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NefmP08553 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NefmP08553 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
NefmP08553 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NefmP08553 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NefmP08553 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
NefmP08553 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
NefmP08553 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
NefmP08553 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
NefmP08553 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
NefmP08553 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NefmP08553 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NefmP08553 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NefmP08553 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NefmP08553 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NefmP08553 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NefmP08553 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NefmP08553 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NefmP08553 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NefmP08553 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NefmP08553 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NefmP08553 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NefmP08553 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NefmP08553 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NefmP08553 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NefmP08553 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NefmP08553 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NefmP08553 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NefmP08553 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NefmP08553 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms