Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ItgamP05555 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ItgamP05555 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ItgamP05555 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ItgamP05555 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ItgamP05555 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ItgamP05555 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ItgamP05555 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ItgamP05555 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ItgamP05555 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ItgamP05555 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ItgamP05555 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ItgamP05555 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ItgamP05555 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ItgamP05555 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ItgamP05555 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ItgamP05555 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ItgamP05555 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ItgamP05555 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ItgamP05555 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ItgamP05555 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ItgamP05555 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ItgamP05555 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ItgamP05555 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ItgamP05555 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ItgamP05555 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ItgamP05555 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ItgamP05555 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ItgamP05555 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ItgamP05555 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ItgamP05555 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ItgamP05555 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ItgamP05555 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ItgamP05555 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ItgamP05555 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ItgamP05555 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ItgamP05555 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ItgamP05555 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ItgamP05555 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ItgamP05555 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ItgamP05555 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ItgamP05555 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ItgamP05555 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ItgamP05555 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ItgamP05555 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ItgamP05555 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ItgamP05555 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ItgamP05555 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ItgamP05555 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ItgamP05555 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ItgamP05555 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ItgamP05555 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ItgamP05555 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ItgamP05555 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ItgamP05555 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ItgamP05555 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ItgamP05555 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ItgamP05555 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ItgamP05555 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ItgamP05555 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ItgamP05555 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ItgamP05555 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ItgamP05555 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ItgamP05555 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ItgamP05555 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ItgamP05555 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ItgamP05555 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ItgamP05555 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ItgamP05555 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ItgamP05555 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ItgamP05555 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ItgamP05555 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ItgamP05555 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ItgamP05555 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ItgamP05555 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms