Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mtatp6P00848 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mtatp6P00848 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mtatp6P00848 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mtatp6P00848 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mtatp6P00848 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mtatp6P00848 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mtatp6P00848 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mtatp6P00848 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mtatp6P00848 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mtatp6P00848 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mtatp6P00848 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mtatp6P00848 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mtatp6P00848 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mtatp6P00848 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mtatp6P00848 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mtatp6P00848 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mtatp6P00848 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mtatp6P00848 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mtatp6P00848 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mtatp6P00848 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mtatp6P00848 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mtatp6P00848 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mtatp6P00848 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mtatp6P00848 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mtatp6P00848 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mtatp6P00848 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mtatp6P00848 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mtatp6P00848 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mtatp6P00848 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mtatp6P00848 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mtatp6P00848 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mtatp6P00848 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mtatp6P00848 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mtatp6P00848 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mtatp6P00848 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mtatp6P00848 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mtatp6P00848 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mtatp6P00848 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mtatp6P00848 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mtatp6P00848 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mtatp6P00848 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mtatp6P00848 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mtatp6P00848 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mtatp6P00848 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mtatp6P00848 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mtatp6P00848 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mtatp6P00848 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mtatp6P00848 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mtatp6P00848 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mtatp6P00848 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mtatp6P00848 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mtatp6P00848 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mtatp6P00848 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mtatp6P00848 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms