Protein–RNA interactions for Protein: O89112

Lancl1, LanC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl1O89112 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lancl1O89112 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lancl1O89112 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lancl1O89112 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lancl1O89112 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lancl1O89112 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lancl1O89112 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lancl1O89112 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lancl1O89112 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lancl1O89112 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lancl1O89112 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Lancl1O89112 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Lancl1O89112 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lancl1O89112 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lancl1O89112 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lancl1O89112 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lancl1O89112 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lancl1O89112 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lancl1O89112 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lancl1O89112 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lancl1O89112 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lancl1O89112 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lancl1O89112 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lancl1O89112 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lancl1O89112 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lancl1O89112 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lancl1O89112 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lancl1O89112 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lancl1O89112 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lancl1O89112 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lancl1O89112 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lancl1O89112 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lancl1O89112 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lancl1O89112 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lancl1O89112 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lancl1O89112 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lancl1O89112 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lancl1O89112 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lancl1O89112 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lancl1O89112 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lancl1O89112 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lancl1O89112 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lancl1O89112 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lancl1O89112 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lancl1O89112 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lancl1O89112 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lancl1O89112 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.1 ms