Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Robo1O89026 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Robo1O89026 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Robo1O89026 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Robo1O89026 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Robo1O89026 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Robo1O89026 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Robo1O89026 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Robo1O89026 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Robo1O89026 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Robo1O89026 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Robo1O89026 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Robo1O89026 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Robo1O89026 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Robo1O89026 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Robo1O89026 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Robo1O89026 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Robo1O89026 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Robo1O89026 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Robo1O89026 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Robo1O89026 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Robo1O89026 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Robo1O89026 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Robo1O89026 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Robo1O89026 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Robo1O89026 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Robo1O89026 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Robo1O89026 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Robo1O89026 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Robo1O89026 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Robo1O89026 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Robo1O89026 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Robo1O89026 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Robo1O89026 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Robo1O89026 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Robo1O89026 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Robo1O89026 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Robo1O89026 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Robo1O89026 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Robo1O89026 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Robo1O89026 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Robo1O89026 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Robo1O89026 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Robo1O89026 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Robo1O89026 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Robo1O89026 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Robo1O89026 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Robo1O89026 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Robo1O89026 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Robo1O89026 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Robo1O89026 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Robo1O89026 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Robo1O89026 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Robo1O89026 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Robo1O89026 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Robo1O89026 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Robo1O89026 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Robo1O89026 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Robo1O89026 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Robo1O89026 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Robo1O89026 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Robo1O89026 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Robo1O89026 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Robo1O89026 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Robo1O89026 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Robo1O89026 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Robo1O89026 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Robo1O89026 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Robo1O89026 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Robo1O89026 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Robo1O89026 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Robo1O89026 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Robo1O89026 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Robo1O89026 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Robo1O89026 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Robo1O89026 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Robo1O89026 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Robo1O89026 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Robo1O89026 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Robo1O89026 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Robo1O89026 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Robo1O89026 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Robo1O89026 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Robo1O89026 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Robo1O89026 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Robo1O89026 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Robo1O89026 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Robo1O89026 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Robo1O89026 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Robo1O89026 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Robo1O89026 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Robo1O89026 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Robo1O89026 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Robo1O89026 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Robo1O89026 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Robo1O89026 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Robo1O89026 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Robo1O89026 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Robo1O89026 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Robo1O89026 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms