Protein–RNA interactions for Protein: O88974

Setdb1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb1O88974 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Setdb1O88974 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Setdb1O88974 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Setdb1O88974 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Setdb1O88974 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Setdb1O88974 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Setdb1O88974 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Setdb1O88974 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Setdb1O88974 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Setdb1O88974 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Setdb1O88974 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Setdb1O88974 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Setdb1O88974 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Setdb1O88974 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Setdb1O88974 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Setdb1O88974 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Setdb1O88974 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Setdb1O88974 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Setdb1O88974 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Setdb1O88974 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Setdb1O88974 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Setdb1O88974 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Setdb1O88974 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Setdb1O88974 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Setdb1O88974 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Setdb1O88974 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Setdb1O88974 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Setdb1O88974 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Setdb1O88974 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Setdb1O88974 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Setdb1O88974 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Setdb1O88974 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Setdb1O88974 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Setdb1O88974 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Setdb1O88974 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Setdb1O88974 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Setdb1O88974 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Setdb1O88974 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Setdb1O88974 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Setdb1O88974 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Setdb1O88974 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Setdb1O88974 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Setdb1O88974 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Setdb1O88974 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Setdb1O88974 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Setdb1O88974 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Setdb1O88974 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Setdb1O88974 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Setdb1O88974 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Setdb1O88974 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Setdb1O88974 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Setdb1O88974 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Setdb1O88974 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Setdb1O88974 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Setdb1O88974 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Setdb1O88974 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Setdb1O88974 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Setdb1O88974 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Setdb1O88974 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Setdb1O88974 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Setdb1O88974 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Setdb1O88974 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Setdb1O88974 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Setdb1O88974 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Setdb1O88974 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Setdb1O88974 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Setdb1O88974 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Setdb1O88974 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Setdb1O88974 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Setdb1O88974 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Setdb1O88974 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Setdb1O88974 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Setdb1O88974 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Setdb1O88974 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Setdb1O88974 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Setdb1O88974 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Setdb1O88974 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Setdb1O88974 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Setdb1O88974 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Setdb1O88974 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Setdb1O88974 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Setdb1O88974 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Setdb1O88974 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Setdb1O88974 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Setdb1O88974 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Setdb1O88974 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Setdb1O88974 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Setdb1O88974 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Setdb1O88974 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Setdb1O88974 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Setdb1O88974 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Setdb1O88974 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Setdb1O88974 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Setdb1O88974 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Setdb1O88974 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Setdb1O88974 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Setdb1O88974 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Setdb1O88974 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Setdb1O88974 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Setdb1O88974 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms