Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slc9a3G3X939 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc9a3G3X939 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc9a3G3X939 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc9a3G3X939 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc9a3G3X939 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc9a3G3X939 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc9a3G3X939 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc9a3G3X939 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc9a3G3X939 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc9a3G3X939 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc9a3G3X939 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc9a3G3X939 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc9a3G3X939 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc9a3G3X939 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc9a3G3X939 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc9a3G3X939 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc9a3G3X939 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc9a3G3X939 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc9a3G3X939 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms