Protein–RNA interactions for Protein: G3UXR8

Gm20532, Predicted gene 20532, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20532G3UXR8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20532G3UXR8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20532G3UXR8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20532G3UXR8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20532G3UXR8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20532G3UXR8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20532G3UXR8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm20532G3UXR8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20532G3UXR8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20532G3UXR8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20532G3UXR8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20532G3UXR8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20532G3UXR8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20532G3UXR8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20532G3UXR8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20532G3UXR8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20532G3UXR8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20532G3UXR8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20532G3UXR8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20532G3UXR8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20532G3UXR8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20532G3UXR8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20532G3UXR8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms