Protein–RNA interactions for Protein: G3UW59

Ubap1l, MCG16443, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubap1lG3UW59 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Ubap1lG3UW59 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ubap1lG3UW59 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ubap1lG3UW59 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ubap1lG3UW59 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ubap1lG3UW59 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ubap1lG3UW59 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ubap1lG3UW59 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ubap1lG3UW59 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ubap1lG3UW59 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ubap1lG3UW59 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ubap1lG3UW59 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ubap1lG3UW59 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Ubap1lG3UW59 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ubap1lG3UW59 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ubap1lG3UW59 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ubap1lG3UW59 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ubap1lG3UW59 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ubap1lG3UW59 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ubap1lG3UW59 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ubap1lG3UW59 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ubap1lG3UW59 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ubap1lG3UW59 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ubap1lG3UW59 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ubap1lG3UW59 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ubap1lG3UW59 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ubap1lG3UW59 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ubap1lG3UW59 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ubap1lG3UW59 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ubap1lG3UW59 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ubap1lG3UW59 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Ubap1lG3UW59 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ubap1lG3UW59 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ubap1lG3UW59 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ubap1lG3UW59 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ubap1lG3UW59 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ubap1lG3UW59 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ubap1lG3UW59 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Ubap1lG3UW59 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Ubap1lG3UW59 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ubap1lG3UW59 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ubap1lG3UW59 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Ubap1lG3UW59 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ubap1lG3UW59 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ubap1lG3UW59 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ubap1lG3UW59 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ubap1lG3UW59 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ubap1lG3UW59 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ubap1lG3UW59 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ubap1lG3UW59 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ubap1lG3UW59 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ubap1lG3UW59 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ubap1lG3UW59 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ubap1lG3UW59 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ubap1lG3UW59 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ubap1lG3UW59 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ubap1lG3UW59 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ubap1lG3UW59 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ubap1lG3UW59 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ubap1lG3UW59 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ubap1lG3UW59 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ubap1lG3UW59 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ubap1lG3UW59 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ubap1lG3UW59 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ubap1lG3UW59 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Ubap1lG3UW59 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ubap1lG3UW59 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ubap1lG3UW59 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ubap1lG3UW59 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Ubap1lG3UW59 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ubap1lG3UW59 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ubap1lG3UW59 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ubap1lG3UW59 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ubap1lG3UW59 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ubap1lG3UW59 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ubap1lG3UW59 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ubap1lG3UW59 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ubap1lG3UW59 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ubap1lG3UW59 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ubap1lG3UW59 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ubap1lG3UW59 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ubap1lG3UW59 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ubap1lG3UW59 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ubap1lG3UW59 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ubap1lG3UW59 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ubap1lG3UW59 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ubap1lG3UW59 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ubap1lG3UW59 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ubap1lG3UW59 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ubap1lG3UW59 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ubap1lG3UW59 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ubap1lG3UW59 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ubap1lG3UW59 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ubap1lG3UW59 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ubap1lG3UW59 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ubap1lG3UW59 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ubap1lG3UW59 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ubap1lG3UW59 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ubap1lG3UW59 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ubap1lG3UW59 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms